Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 07-25-2018
断れない筋から頼まれたので、ほぼ何も知らないことについて学会で25分発表をしなくてはいけなくなった。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 10-21-2017
金沢で開催された学会に参加した。１０月に日本にいるのは２０年ぶりくらいかな。
おいしい物をいろいろ食べた。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 05-02-2013
バイオスタットの大学院生あいてに臨床試験のクラスを教えた。今回が２度目。ついさっき期末試験の採点を終えた。
生徒の数は６人。とある問題に、僕の（模範）解答と合わせて７種類の答がそろった。自分の答が合っているかどうかの自信もなくなる。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 12-20-2012
とある人の研究企画書を読んだ．どちらかというとまだ学生の領域にいる人だ．でもバイオスタットのクラスもとったし，サンプルサイズ（何人からデータを集めなくてはいけないか）の計算なんかも自分でやっていた．
サンプルサイズの計算には「データがどれだけばらつくか」の指標がいる．標準偏差とか分散とかだ．同じような研究はまだあまりなくて，出版された唯一の論文のデータを使って標準偏差を求めていた．
問題は，その論文でのサンプルサイズが３だったということだ．
しかも丁寧に９５％信頼区間まで計算していた．
平均，標準偏差，信頼区間（下限，上限）を報告していたので，３つの数値から４つの数字を計算して報告したことになる．いくらなんでもそれは変だ．サマリーではない．
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 11-18-2012
US News という雑誌がいろんなランキングを毎年発表する。大学とか大学院とか病院とか。ま、いろいろ。かなり影響力があるランキングだ。うちの癌センターも、僕が働き始めた頃は 15位くらいにランクされていて、2010年までに10位 "10 by 10" というのを目標に掲げていた。いつのまにか 10 by 10 を聞くことはなくなった。最近ランクを見てないなぁ、と思ったら25位から30位のあいだにいるようだ。
このランキングの詳細をよく見てみたのだけど、かなりあやしい。意義は理解できるのだけど、システムとして機能していない。
こんなランキングを気にしなくていい、と言いたいところだけど、だめだめなランキングな割に影響力が大きいので、全く気にしない訳にはいかない。「ヴァンディーの癌センター、昔は15位だったのに今は30位だよ」という見られ方をするので、癌センターのクオリティーは全く変わっていないのに、評判が悪くなってしまう。
キーワードは「評判」 reputation。
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このランキングがどうやって計算されているか、かなりちゃんと報告されている。全てが明白という訳ではないけれど、100ページくらいのリポートを読めば、どういう指標を使ってどんな計算をしているのか、だいたいわかる。
最近のリポート (2012 - 2013) の説明は ここ (pdf)。
5,000くらいの病院のうち、ベッドが100以上とか、いくつかの条件を満たす 2200 くらいの病院がランキングに含まれているようだ。
ランキングは、18の指標に基づいて計算されている。患者の生存期間スコア（0-10）とか、患者の安全スコア（0-3）とか、手術後の出血阻止スコアとか、看護婦と患者の比とか、などなど。こういう指標が18個もある。それぞれについて、どういうデータを集めてどういう計算をしているか、その指標が何を表しているのか、というのが125 ページに渡って説明されている。
癌は12個のカテゴリーのうちのひとつ。心臓科、耳鼻科、婦人科、腎臓科、泌尿器科など、それぞれのランキングが発表されている。僕が見たのは癌だけ。ま、信ぴょう性の無さは他もいっしょだろうけど。
一瞥したら、18もの深慮された指標があるんだから立派なランキングなんだろうと思われがちだ。詳しく見てみた。トップ50の病院について、総合点と18のスコアが発表されている。
18のスコアから総合点をどう計算するかは発表されていない。50ものデータがあるんだから、それは推測できる。単純に回帰解析をしてみた。
すると、18の指標のうち 1つだけで総合点がほぼ決まっていることが判明した。
Y軸が最終的なスコア。トップが100点になるようになっている。X軸がとある指標。相関は 0.96。
さらにこの X と Y の関係を見ると、X の平方根をとれば相関はもっと高いはずだと気づく。X=0 だった３つのデータを除いて Xの平方根とYの相関を計算したら0.99だった。もうほかのデータの入り込む余地はない。
つまり、生存率がどうこうとか、安全スコアがどうこうとか、いろいろいろいろ点数化して計算しているけれど、この指標ひとつだけで総合点、つまり順位がほぼ決まる。他の指標ははっきり言ってどうでもいい。
このグラフによるとトップ5は抜きん出ている。トップ15に入るには団子状態から抜けださなくてはいけない。
この指標が何かというと・・・ reputation。つまり、評判。いろいろ客観的な指標を使っているにも関わらず結局主観的な「評判」だけで順位が決まっていると言っても過言ではない。
そんな訳で、どうやってこの評判スコアが決まっているか見てみた。
医者にアンケートで「あなたの分野で最高の治療を施す病院を5個あげて下さい」と聞く。それがデータだ。過去3年分のデータがカウントされるらしい。
誰にアンケートを送りつけるかは医者目録に登録されている約85万人からランダムに選んでいるらしい。全ての州から選ばれるということだ。
みんながみんなアンケートに答えるという訳ではない。過去三年の応答割合 (response rate) が載っているが、癌の分野は40%というところだ。それで得られた回答数は 74 (2011年）。アメリカ全体で74人。74人の医者がそれぞれ上位5位までの病院を答える。それで、評判スコアが決まる。
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ヴァンディーはこの年（2011年）26位だった。1位だった MD Anderson と比べてみると Survival (生存）スコアは 9-10 で負け、合併症スコアは 2-3 で負けだけど、安全スコア (2-1)、出血阻止スコア (2-1)、看護婦スコア (2.1 - 2.0) では勝っている。ベッドの数 (4178 - 1322) は大きく負けているけど、残りの指標はみんな引き分け。こういうスコアは最終ランキングにほぼ影響なし。評判スコアが MD Anderson が78.9、ヴァンディーが 3.1。これで総合順位が1位と26位だ。MD Anderson の癌センターがトップなことに異論はないけれど、このスコアの付け方であっちが1位、こっちが26位は納得できないよね。
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そんな訳だけど、このランキングはかなり影響力がある。ヴァンディーもまた10代に戻りたいんだと思う。何を変えればいいか？もっとクオリティーの高い治療を提供すればいい、という訳ではない。そこにあまり伸びしろはないし、クオリティーを上げたところで最終ランキングにほぼ影響がない。アンケートに当たった医者が「癌の治療と言えば・・・」と考えた時にヴァンディーを思い浮かべるようにすればいいのだ。そんな訳で、近年ヴァンディーはテレビコマーシャルを全国区で流したり、そういった努力をしている。
癌センターのお偉いさん方に生物統計グループ（僕じゃないけど）がこのランキングの解析を頼まれたのは事実だから、最近のPR戦略に走る一つの要因になっているかもしれない。
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世の中にはいろんなランキングがあふれている。US News とか Buisiness Week だとか、一見ちゃんとしている人がやっていそうな気がする。でも鵜呑みにしてはいけない。少なくとも US News のランキングはどうしようもなく低レベルだ、ということだ。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 01-23-2012
臨床試験のクラスを教えている。臨床試験と実験計画法についてだ。生物統計学科の修士課程、博士課程の生徒が取るクラスなので遠慮なく数理統計のクラスにしている。他にも、疫学科の生徒とか、ケミカルバイオロジーとかの生徒も混ざっている。たぶん、コースのタイトルにある実験計画法につられて来たんだと思う。
今日までに疫学の生徒（など）がまとめていなくなった。想像していたクラスと違ったらしい。ま、そうだろうなぁ。臨床試験の（をだしにした？）数理統計っぽいクラスで、臨床試験の一般的な知識が増えるクラスではない。最初は生徒１０人くらいかな、と思っていたら聴講の生徒を含めて２０人強いたのですこしびびっていた。今はかなり減ったけれど。１０人～１５人くらいに落ち着いてくれるとうれしい。
◯◯
授業の準備って大変だけど、想像していたのより楽しい。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 12-10-2011
１０月にヴァンダービルト大学がとあるギネス記録を更新した。僕も貢献した。
「１日で何人にインフルエンザ予防接種を出来るでしょうか」記録。
記録は 12,850人。確か８時間だったか。今までの記録が 6,000人強だったので、一気に二倍。
つい先週、ヴァンダービルトの記録が正式にギネス記録として登録されたというニュースがあった。
平均で１分に３０人弱に注射をしていたことになるので、かなりの規模だ。たしか常時４０人が注射をしていた、とかそんなんだったと思う。
緊急時に大学関係者に速やかに予防接種をするプランというのがあるのだけど、それのテストを兼ねてのイベントだったらしい。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 10-13-2011
New England Journal of Medicine (NEJM) という医学雑誌がある。最も歴史が長く、たぶん最も読まれていて、たぶん最も影響力が強い医学雑誌だ。NEJM には統計査読担当者が４人いて、そのうちのひとりである David Harrington の話を聞く機会があった。
彼によると、投稿された論文のうちの 62% は編集長と編集委員が掲載拒否（reject）する。32% は査読の後 reject となる。2% は大幅な訂正の後、またスタート地点（編集長）に戻る。つまり NEJM に載るのは投稿された論文のうちの 4% ということだ。倍率２５倍。
統計の査読は、査読の過程のうちの最集段階。編集長⇒編集委員⇒査読者⇒ミーティングというステップの後で、統計査読になる。ここまで来る論文はかなりの難関をくぐり抜けているということだ。それにも関わらず、この統計査読まで到達した論文のうち 20% 弱が reject となる。大幅な、あるいは若干の訂正を経て合格になるのは約半分。残りは査読担当の４人の専門外の知識が必要なため別の査読者に回されるとのことだ。
彼の一番の不満は、lack of clarity（何をやったか不明瞭）だと言っていた。紙の学会誌の時代からデジタルの時代になったので、ページ数にかなり余裕があるようになった。論文自体は簡潔にして、統計手法を３０ページの付記に載せたという例もあるそうだ。
いろいろと合格の確率をあげる技を教えてくれたのだけど、一番分かりやすかったのが７月８月に投稿する、というのだ。夏休みで投稿の数が減るけれど採用される数は変わらないので、自然とハードルが下がると言っていた。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 10-07-2011
今日、金曜日なのに午後４時から、とあるリサーチグループのミーティングがあった。初めてのミーティング。
全部で８人集まったのだけど、僕を除いてみんな白人女性だった。
ま、いいんだけどね。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 08-15-2011
１回で答がみつかることはまれだ。繰り返し探すから re search リサーチと言う。
英語のだじゃれ。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 07-19-2011
３ヶ月ぶりに髪を切った。切る前はかなりぼさぼさだった。１ヶ月ぶりにヒゲをそった。剃る前はかなりぼうぼうだった。
すっきりした。
明日からバケーションだからだ。写真もいっぱい撮るだろうしね。
仕事モードに戻るときっとまたぼさぼさになるんだろうな。
よく考えたら逆なような気がした。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 07-10-2011
このあいだ仕事で日本に行ったのだけど、「ほんとに仕事で日本に行った」という書類を提出する必要に迫られた。ま、出張届けみたいなものだ。
でも英語で書かれたものが何もない。メールも日本語だし、ウェブページの情報も日本語のみだ。ま、別にそこまで厳密にやる必要は全くないのだけど、グーグル翻訳で英訳してみた。
こんな感じになった。
14:05 to 14:35
Dalai overview of adaptive design
Koyama (Vanderbilt University)
ダライって何なんだろう？達樹の英訳か？よく分からないな。偶然、次の演者も小山さんだった。コヤマさんだ。
14:35 to 15:05
***** Oyama
FDA guidance on adaptive designs (******** Co., Ltd.)
なぜかこちらはオヤマさんになっている。なぜだ？よく分からないな。
★★
もう一つの会の予定も英訳してみた。
13:00 to 15:00
Da Xiao Shu (biostatistics at Vanderbilt University) for the adaptive design in the U.S. real]
勝手に中国人ぽくするなよ。「日本語⇒英語」翻訳とちゃんと指定しているのに。
★★
どちらもちゃんと出張報告として受け取って頂いた。ま、何でも良かったのだろうけど。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 01-29-2011
昨年の暮れに「ダイナマイトプロット撲滅ポスター」を和訳した。このブログに２００６年に 書いた のが始まりで、その後英語で ポスター を書いた。
そのポスターの日本語版。日本語の方が英語より長くなるので、少しだけはしょっている。
ダイナマイトに 気をつけて (pdf)
データを図を使って表すのは、データの分布に興味があるからだ。平均値と標準誤差を知りたいだけだったら、わざわざ図にしなくても良い。表で事が足りる。
話すと長くなるのでやめる。
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 09-20-2010
今年も State of the Medical Center 演説の季節がやってきた．去年（予算関係はなぜか７月が新年の始まり）のは 不景気だったけどがんばりました という感じだったのに比べて，今年は「もう結構絶好調ですぜ」という感じだった．去年は全体で９千万ドルの赤字だったけれど，今年は約１億ドルの黒字だったそうだ．計画だけあって無期限延期になっていた，新しい建物建設の話もそろそろ復活するらしい．
今，ヴァンダービルトは大学から３０分ほど南の隣の郡 (Williamson) に，Vanderbilt Williamson として，幾つも小さなオフィスを構えているのだけど，それをまとめるために，２２エーカーの土地を購入したということだ．本キャンパス（メディカルセンター部分）の約半分の大きさというから，結構本気だ．日産本社からちょこっと南に行ったところ．
大学病院内での健康食促進のために，マクドナルドを追い出すことを決めた．これは１ヶ月ほど前から ニュースになっていた ので，目新しい話題ではない．来年の１月からは Au Bon Pain だ．注文する物によっては結構カロリーは高いそうだけど，ヴァンダービルトがお店を選抜する過程で提出してもらった，健康食推進の心構えが一番良かったそうな．Au Bon Pain はアメリカ国内で６段階の値段設定があって，ヴァンディーにできる店舗は一番安い値段設定になるように交渉したらしい．商売をする場所としてはかなり良いからね．電話で前もって注文して店では受け取るだけ，ということも出来るようになるらしい．
他にも，カフェテリアで健康食品に指定されているものは，ヴァンディー職員に限って１０月１日から 25% 引きで買えるらしい．今でも 10% 引きらしいのだけど，知らなかった．
癌センターの一番メインの研究助成金（存在そのものの資金）の更新が今年の１月にあって，そこでの競争相手を含めて，ヴァンディーはベストスコアだった．ちなみに額面は向こう５年間で約３０００万ドル．１年あたり６００万ドル．そんなものか．もっと多いと思っていたけど．
来月から，テレビでコマーシャルを始めるということだ．"Vanderbilt University Medical Center / The promise of discovery" とかいうタイトルで．ローカルだけではなくて，全国区で流すってさ．教育機関として初めてＣＮＮの ヘッドラインニュース のスポンサーになる．そのコマーシャルが何種類かあるのだけど，そのうちのひとつに，顕微鏡を覗き込んだりしているＯ橋先生の姿があった．全国区ですよ！
内部の人間であれば ここ で見れる．テレビのコマーシャルは最後の５分くらい．
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 09-09-2010
来週 School for Science and Math というところで，一時間の講義をすることになった．これがどういうところか，よく判っていないのだけど，どうやら理数系に秀でた高校生が，週一でヴァンダービルトで科学と数学に関する授業を受けるようだ．
しかも相手は高校生一年生ということらしい．日本では中学生だ．この間，１９歳の人たち相手に 授業をした けれど，今回はもっと若い．
高校生相手に何をしゃべればいいんだ？でも，担当の先生からあまり細かな指示が無いことをいいことに，勝手にいろいろ話してしまおう．
その準備の一環で，ここ に書いた平均への回帰をもう一度見てみた．
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メジャーリーグのシーズン開幕はだいたい４月の始めだ．１ヶ月経ったところで，５０人の選手を選んで，２５人ずつのふたつのグループに分けた．グループ１には，一日だけ秘密の特訓を行った．グループ２には「ホメオトシー」というひたすら誉めまくって自信をつけさせる，という最近はやりの治療を施した．
下のグラフは ５月の打率 - ４月の打率 を現している．0 より下は打率が下がったということだ．秘密の特訓グループの多くの選手が打率を下げたのに大して，ホメオトシーグループの選手はほぼ全員が打率をあげた．中には 0.2 もあげた選手もいる．つまり４月には１割５分だったのが，５月は３割５分だった，ということだ．
ホメオトシー，すごいな．
... ... ...
実は全くすごくない．
実は，無作為に選んだ５０人ではなくて，秘密の特訓グループは４月の打率が高かった２５人で，ホメオトシーグループは４月の打率が低かった２５人だ．だから，特に何もしなくても，５月の打率は特訓グループでは下がる傾向があるし，ホメオトシーグループでは上がる傾向にある．
特筆するようなこと，というのは長くは続かない．高い値は平均値に向かって落ちてくる傾向があるし，低い値は平均値に向かって上がって行く傾向がある．
それだけ．
でも，気がつかずにいろんなところでだまされているかもしれない．ホメオトシーにもだまされてはいけない．
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 08-14-2010
興味本位で，日本の製薬会社の求人情報を集めているサイトを見てみた．求人の情報って転職，就職する気が皆無な人が見るとなかなか面白い．
「統計解析」という分野があったのでそれを見てみた．
応募基準の学歴が「大卒以上（原則として）」だったりしてかなりショッキングな内容だった．日本の（生物）統計の世界が人材不足なのは知っていたけれど．．．「理系出身者尚可」って．そこまで行くと，ちょっとさすがにどうかと思う．
でも一番おもしろかったのは「コミュニケーション力に長け，適切に協同行動が取れる人材」という資格だ．
うちの統計学部でも，採用基準のかなり上の方に「コミュニケーション力」が来る．英語がちゃんとできない人を落とす意味もあるけれど，共同研究をする上で，統計担当者のコミュニケーション力（日本語ないの？）はかなり大切だからだ．
博士号を持っている，あるいは取得する予定の人にはたいてい「あなたの（博士課程の）研究のすごいところを，統計の知識の無い人にも判るように説明してみて下さい」とか訊く．
修士の人には，基本的な知識の有無を確かめる意味も込めて，解析結果を見せて「この結果を，統計の知識の無い人にも判るように説明してみて下さい」とか訊く．
．．．
「適切に協同行動がとれる人材」．いいなぁ．この世界だとかなり重要だよね．
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 08-06-2010
北米で一番大きな統計学の学会，ＪＳＭに参加するためにバンクーバーに行った．ＪＳＭには過去２年間行っていなかったから久しぶりと言えば久しぶりだ．来年はマイアミなのでたぶん行かない．誰が８月に好んでマイアミに行くか．しかも３月にある別の学会 ENAR もマイアミだ．むちゃくちゃだ．
久しぶりに発表をした．１５分だから大したことは言えないけれどね．ガラス張りの立派な部屋だったんだけど，その割りに観客動員数がしょぼかった．ま，いいんだけど．
今回の学会は，いろんな発表を見る，というよりも，いろんな人に会っていた．ピット統計組も結構来ていたなぁ．日本から参加された人にもたくさんあった．Ｚ大学のＰさん（仮名）と「最近の若者は～」という話をした．
アメリカ，カナダにいる日本人のスタティスティシャンの方たちと食事に行った．これが今回のメインイベントだ．自分と似たような環境にいる人たちなので，これもうれしい．去年から定例でＪＳＭの時に集まってご飯を食べに行くことになっている．
昔は（僕の中では） Japanese Epidemiologists and Statisticians in the US の頭文字で JESUS ジーザスという名前だったのだけど，Epi の人はちょっと別でお願いしますということで，カナダの人もいれたいしで，名前は今のところない．
Ｒの nlme パッケージとか この Mixed-Effects の本の著者の Jose Pinheiro さんに会った．ホゼさんんかと思っていたら，ジョゼさんだった．ブラジルではそういうことになっているらしい．
やっぱり，しゃきしゃきと頭の切れる人だった．
ジョゼさんも含めてペーパーを書こうかな，ということになっているのだけど，ちゃんと書けるかな．何だか哲学的な話に向かって行って最後にどこにたどり着いたかは不明のままだ．
バンクーバーはとても涼しかった．肌寒いこともあった．スターバックスばっかりだった．ティムホートンズ は少し負けていた．
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 08-03-2010
みんな知っていることなのかもしれないけれど，ウルトラマンの背番号は７．
おいしいおいしいという名前の日本食レストラン．どう考えても怪しいけれどほんとにおいしかった．
たぶん，なかなか行く機会が無いガソリンスタンド．
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 03-23-2010
土曜日からニューオーリンズでの学会に来ている．ENAR だ．Eastern North American Region. 東部北アメリカ地区．
国際計量生物学会の ENAR．
例年に比べると（ここ２年間参加していなかったけれど）かなりこじんまりとしている印象だ．あまり景気が良くないからなんだろうな．学会参加費用なんか真っ先に予算カットされそう．
ところで，今日参加したセッションのひとつで，延べ７つの講演のうち４つが同じ大学の関係者だった．教授と，その教え子ふたりと元教え子．なんだそれは．そういうのは内輪でやってくれ．
それだけ参加者が少ないということか．羽振りの良い大学からの参加者が多いということか．
Sunday, Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, 01-26-2010
Under-promise and over-deliver.
控えめに見積もって期待以上の成果をだせ，ということだ．
接客業でよく言われるようだ．例えば「来週の火曜日までにできます」と言って，がんばって月曜日に終わらせる．
逆の over-promise and under-deliver は言わば「口ばっかりでかいこと言いやがって，行動がともなってないんだよ」ということだ．
"Under-promise and over-deliver" は仕事で共同研究者と論文を書くときに頭においておくようにしている．
すごく労力をかけてデータを集めると，それを使っていろんな結論を出したくなる．でも，無理矢理導かれた結論というのは，やっぱり真実ではないことがほとんどだ．
データを正確に（というか正直に）解析する統計学者の仕事は，感情に押し流されがちな共同研究者に現実を見つめさせることでもある．
A:「我々は乳ガンの早期発見につながるバイオマーカーをみつけた！」
B:「あなたのデータからはそんなことは言えない．」
B:「そう言った傾向がないことはないかもしれないけれど，あなたのデータはそうは示していない．」
そういうことを伝える．
乳がんだけに限らず，最近「発見」されたバイオマーカーで，独立した新たなデータで再確認 (reproduce) されたマーカーは極めて少ない．